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芦笋基因组计划国际合作项目“芦笋基因组测序分析”研讨会在上海召开

时间:2014-10-22 17:31 来源:花卉所 编辑:周劲松 审核:吴罗发
2014年10月12日,由我院主持的芦笋基因组计划国际合作项目“芦笋基因组测序分析”研讨会在上海复旦大学江湾校区生命科学学院召开。项目首席科学家、我院陈光宇研究员主持研讨会,美国乔治亚大学植物生物学系、中国科学院植物研究所、中国热带农业科学院生物技术研究所、

2014年10月12日,由我院主持的芦笋基因组计划国际合作项目“芦笋基因组测序分析”研讨会在上海复旦大学江湾校区生命科学学院召开。项目首席科学家、我院陈光宇研究员主持研讨会,美国乔治亚大学植物生物学系、中国科学院植物研究所、中国热带农业科学院生物技术研究所、同济大学生命科学与技术研究院,以及深圳华大基因研究院等单位相关研究人员参加了研讨会。

研讨会就芦笋基因组组装优化、科知识题个性化分析、数据分享与数据库构建、论文撰写及分工等问题进行深入讨论,并部署了后续工作。

据悉,项目组为了提高芦笋基因组的最终组装质量,在既定的第二代测序技术Illumina Solexa HiSeq2000测序分析基础上,利用第三代测序技术PacBio对芦笋基因组进行补充测序,已获得5.0×覆盖度的PacBio数据,即将完成基因组PBJelly拼接优化工作;同时,芦笋性染色体和性别决定基因分析取得突破性研究进展,已成功鉴定出芦笋雌性抑制基因和多个雄性特征基因,这将有助于揭示被子植物雌雄异株性别决定和性染色体进化的分子机制。此外,正在挖掘芦笋基因组中所蕴含的营养药用价值、抗旱耐盐碱等分子机理。


“芦笋基因组测序分析”研讨会现场

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